Научно-исследовательская деятельность Уфимского филиала Финуниверситета реализуется в рамках общеуниверситетской комплексной темы «Формирование условий долгосрочного устойчивого развития России: теория и практика» на период 2021-2025 гг. по четырем приоритетным направлениям:

Финансовое обеспечение перехода к опережающему развитию России – «Совершенствование финансово-экономических механизмов стимулирования инновационной активности в реальном секторе экономики» (кафедры «Финансы и кредит», «Экономика, менеджмент и маркетинг», «Математика и информатика», «Бухгалтерский учет, анализ и аудит») – руководитель: Рахматуллина Ю.А.;

Научное обеспечение национальной безопасности России – «Экономическая безопасность как фактор обеспечения национальной безопасности в условиях экономической турбулентности» (кафедра «Бухгалтерский учет, аудит, статистика») – руководитель Бакирова Р.Р.;

Социально-политические, экономические и правовые условия развития человеческого потенциала, общества и государства – «Роль инноваций в системе управления: микро и макро уровни» (кафедра «Экономика, менеджмент и маркетинг») – руководитель: Фасхиев Х.А.;

Развитие цифровых технологий в экономике, обществе и государстве – «Концептуальный базис цифровых интеллектуальных технологий (нейросетей) для диагностики и прогнозирования банкротств корпораций» (кафедра «Математика и информатика») – руководитель: Фархиева С.А.; «Развитие системы стандартов финансового учета и отчетности как отражение новых реальностей цифровой экономики» (кафедра «Бухгалтерский учет, аудит, статистика») – руководитель Растегаева Ф.С.